公司国际旅行社有限公司，小规模企业，旅行社业务方面的开票使用的是开票系统中的差额开票，那么再收到相对应的成本发票，就不用价税分离了吧，税额不再抵减了是吧

选择差额计税方法的，对于规定的准予扣除部分依据规定的合法凭证给予差额扣除计算销项税额；对于其他不作为差额扣除的部分，只要依法取得了增值税进项凭证可以作为进项税额作进项抵扣。 
 
根据《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税〔2016〕36号）附件2《营业税改征增值税试点有关事项的规定》规定：试点纳税人提供旅游服务，可以选择以取得的全部价款和价外费用，扣除向旅游服务购买方收取并支付给其他单位或者个人的住宿费、餐饮费、交通费、签证费、门票费和支付给其他接团旅游企业的旅游费用后的余额为销售额。选择上述办法计算销售额的试点纳税人，向旅游服务购买方收取并支付的上述费用，不得开具增值税专用发票，可以开具普通发票。 
 
因此，旅游服务公司增值税一般纳税人可以选择差额计税方法缴纳增值税。选择差额计税方法的增值税计算： 
 
应纳增值税＝（旅游服务价税合计数－可以差额部分的扣除费用）÷（1+6％）×6％－其他依法取得的符合规定的进项税额＝旅游服务价税合计数÷（1+6％）×6％－可以差额部分的扣除费用÷（1+6％）×6％－其他依法取得的符合规定的进项税额