销售的商品，对方从货款里直接扣掉运费，这个怎么做分录

应按照发生原则，将销售的商品和运费分别记入对应科目，即：  
1.  应收账款：借方金额=商品销售价格，贷方金额=0  
2.  商品销售：借方金额=商品销售价格，贷方金额=0 
3.  应付账款：借方金额=0，贷方金额=运费  
4.  银行存款：借方金额=0，贷方金额=商品销售价格-运费  
 
拓展知识：在实际操作中，如果对方从货款里直接扣除运费，可能会出现账户资金的相互转账，因此，记账时需要仔细分析，正确记录账目。