建筑安装行业预交企业所得税为什么不可以扣除分包单位的分包款，按差额纳税呢，是有哪个文件明确规定了吗？

企业所得税包括查账征收、核定征收。 
一、如果查账征收，则预缴申报以“实际利润额”（税法口径）作为计税依据。通常，分包款项只要符合确认条件，是会作为成本扣除的。 
二、如果核定征收，则以“应纳税所得额=应税收入额×应税所得率”作为计税依据。理论上，应税所得率已经扣除了作为成本组成部分的分包部分，自然不能重复扣除。 
我举个简单例子吧： 
假设收入1000万元，自营成本500万元，分包成本300万元，则利润200万元。此为查账征收。 
假设核定征收，应税所得率20%，也就是相当于成本扣除率80%，这个80%显然已经包含了分包成本。1000×20%=200万元，与上计算相符。如果用1000减300来算，则成本既然已经扣除300万，自然不再是80%了。就是这个道理。