我司是高新技术企业，企业所得税的税率是15%；但是我司又是小型微利企业，又符合（财政部 税务总局公告 2023 年第 12 号）企业所得税的税率实际为5%。那第三季度企业所得税申报时，我司应按哪个税率执行？

根据您提供的信息，您的公司既是高新技术企业，也是小型微利企业。因此，在第三季度企业所得税申报时，您应该根据您公司的具体情况来选择合适的税率。


首先，高新技术企业的企业所得税税率是15%，这是不会变的。因此，如果您的公司仍然符合高新技术企业的认定标准，那么您应该按照15%的税率进行申报和缴纳企业所得税。


其次，小型微利企业的企业所得税税率是5%，并且根据最新的（财政部 税务总局公告 2023 年第 12 号）规定，对于小型微利企业，如果年应纳税所得额不超过100万元的部分，减按12.5%计入应纳税所得额，按20%的税率缴纳企业所得税；如果年应纳税所得额超过100万元但不超过300万元的部分，减按50%计入应纳税所得额，按20%的税率缴纳企业所得税。


因此，如果您的公司符合小型微利企业的认定标准，并且应纳税所得额不超过100万元，那么您应该按照12.5%的税率进行申报和缴纳企业所得税；如果您的公司应纳税所得额超过100万元但不超过300万元，那么您应该按照50%的税率进行申报和缴纳企业所得税。


综上所述，您应该根据您的公司是否符合高新技术企业和小型微利企业的认定标准来确定第三季度企业所得税申报时所适用的税率。