有非同控的甲乙两个企业，甲对乙吸收合并，乙企业可辨认净资产的公允价值中有部分是由存货和固定资产的评估价值高于账面价值所致，支付合并对价后乙公司注销，净资产转入甲公司。那这一笔由于评估价高于账面的金额会如何影响甲公司合并日个别资产负债表中的商誉和股东权益

在非同控的甲乙两个企业中，甲对乙吸收合并后，乙企业的可辨认净资产将以公允价值为基础转入甲公司。如果乙企业可辨认净资产的公允价值中，存在部分由存货和固定资产的评估价值高于账面价值所致，那么这部分差额将计入合并商誉。

合并商誉是指在非同一控制下的企业合并中，购买方对被购买方支付的合并对价超过被购买方可辨认净资产公允价值份额的部分。这部分商誉代表了购买方为获取被购买方的控制权而额外支付的价值。

具体来说，如果乙企业的存货和固定资产在评估价值高于账面价值，那么在合并过程中，这部分价值将被认定为乙企业的可辨认净资产公允价值的一部分。当甲企业支付的合并对价超过这部分可辨认净资产公允价值时，超出的部分将被记录为商誉。

同时，这部分差额也会影响甲公司合并日个别资产负债表中的股东权益。具体而言，当甲企业吸收合并乙企业时，乙企业的所有股东权益将转移到甲企业中。因此，如果乙企业的净资产公允价值高于账面价值，那么这部分差额将增加甲企业的股东权益。

综上所述，这部分由于评估价高于账面的金额将影响甲公司合并日个别资产负债表中的商誉和股东权益。