我这边供应商逾期款无法在发票中扣除了，供应商打现金过来他们和我们都可以做非营业支出/收入吗？

如果供应商逾期款无法在发票中扣除，供应商打现金过来，这种情况不建议双方都作为非营业支出 / 收入处理。
对于供应商来说：
供应商的逾期款属于对其违约行为的一种补偿，一般不应作为非营业支出处理。通常应作为营业外收入的可能性相对较大，但也需要根据具体情况判断是否符合营业外收入的定义。如果只是正常的货款调整，可能需要冲减相应的应收账款等科目。
对于你们公司来说：
如果将收到的现金作为非营业收入处理也不太恰当。如果该逾期款是由于供应商违约产生的违约金等性质的款项，一般应作为营业外收入核算，但如果是货款的调整，则可能需要冲减采购成本或者相应的应付账款等科目。