甲公司购入乙公司100%股权并能实施控制，应当采用成本法核算，选项A错误，选项C正确。非同一控制下，以支付现金、非现金资产等其他方式取得的长期股权投资，应按现金、非现金货币性资产的公允价值或按照非货币性资产交换或债务重组准则确定初始投资成本，甲企业应确认长期股权投资1000万元，选项B正确，选项D错误。