1.政府补助收入要在增值税申报表里填写到免税收入里面吗？ 2.软件即征即退怎么记账？

你这个是免征增值税的，但是不免所得税的吧 
2.一、根据正常销售，确认收入 
借：银行存款或应收账款 
贷：主营业务收入 
应交税费——应交增值税（销项税额） 
二、缴纳增值税时 
本月上交本月应交的增值税 
借：应交税费——应交增值税（已交税金） 
贷：银行存款 
本月上交以前期间应交未交的增值税 
借：应交税费——未交增值税 
贷：银行存款 
三、计提应收的增值税返还 
借：其他应收款 
贷：营业外收入——政府补助 
四、收到增值税返还 
借：银行存款 
贷：其他应收款