发卡机构，收单机构，清算机构的矛盾

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在银行卡跨行交易时，负责多个银行或特许从事金融业务机构（非金融支付机构）之间计算往来资金，并协助完成资金划拨。从对象来看，清算机构业务往来对象银行或是特许经营机构；从业务特点看，清算机构需要两个必备动作，计算资金和协助资金转移。 
因此，可以看出清算机构是一个完成多个发卡机构与多个收单机构之间资金计算与划转的业务主体（即“多对多”），与银行、支付机构“一对多”的结算业务存在较大的差异，其业务中需要应对更大的金融风险。