土地增值税清算时，小区内汽车库（无产权）按普通住宅还是营业房计算的。

纳税人应当根据现行房地产开发流程中持有的“两证一文”来认定，即根据《建设工程规划许可证》、《商品房销售许可证》和《建设项目立项批文》上所注明的房屋用途性质或项目建设内容来判定房产的属性。标注不清楚或标注情况与实际不符的，根据项目的实际用途或实际建设内容进行判定。根据《国家税务总局关于房地产开发企业土地增值税清算管理有关问题的通知》（国税发〔2006〕187号）的规定，房地产开发企业开发建造的与清算项目配套的居委会和派出所用房、会所、停车场（库）、物业管理场所、变电站、热力站、水厂、文体场馆、学校、幼儿园、托儿所、医院、邮电通讯等公共设施，按以下原则处理：1.建成后产权属于全体业主所有的，其成本、费用可以扣除；2.建成后无偿移交给政府、公用事业单位用于非营利性社会公共事业的，其成本、费用可以扣除；3.建成后有偿转让的，应计算收入，并准予扣除成本、费用。因此，若地下车位的所有权未发生转移，仍然属于房地产开发企业所有的，属于出租地下车位，取得的租金收入不征收土地增值税，房地产企业在计算土地增值税时，地下车位的相关成本、费用不能扣除