我公司开出两份增值税发票对方过期未扫描认证我该怎样处理,谢谢

根据国税函〔2009〕617号文件，增值税一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的增值税专用发票、公路内河货物运输业统一发票和机动车销售统一发票，应在开具之日起180日内到税务机关办理认证，并在认证通过的次月申报期内，向主管税务机关申报抵扣进项税额。但如果没有及时认证或没有及时申请抵扣，处理办法如下：
第一，国家税务总局公告2011年第50号和国家税务总局公告 2011年第78号文件，下列客观原因可以继续抵扣：
  （一）因自然灾害、社会突发事件等不可抗力因素造成增值税扣税凭证逾期；
  （二）增值税扣税凭证被盗、抢，或者因邮寄丢失、误递导致逾期； 
  （三）有关司法、行政机关在办理业务或者检查中，扣押增值税扣税凭证，纳税人不能正常履行申报义务，或者税务机关信息系统、网络故障，未能及时处理纳税人网上认证数据等导致增值税扣税凭证逾期；
  （四）买卖双方因经济纠纷，未能及时传递增值税扣税凭证，或者纳税人变更纳税地点，注销旧户和重新办理税务登记的时间过长，导致增值税扣税凭证逾期；
  （五）由于企业办税人员伤亡、突发危重疾病或者擅自离职，未能办理交接手续，导致增值税扣税凭证逾期；
  （六）国家税务总局规定的其他情形。
  第二，除上述原因外，包括工作人员疏忽等，均不能申请继续抵扣，该发票的进项税额只能进入库存商品或主营业务成本，冲抵所得税了。