软件企业研发人员的工资和五险一金应该怎么做账呢？

你好！这个正常做就可以了。 
1.分配工资 
借：××费用（管理/销售等） 
贷：应付职工薪酬——工资 
2.计提社保（企业部分） 
借：××费用（管理/销售等） 
贷：应付职工薪酬——社保 
3.次月发放工资时 
借：应付职工薪酬——工资 
贷：应付职工薪酬——社保（个人部分） 
应交税费——应交个人所得税 
库存现金／银行存款 
4.上交杜保 
借：应付职工薪酬——社保（企业部分+个人部分） 
贷：库存现金/银行存款 
5.上交个人所得税 
借：应交税费——应交个人所得税 
贷：银行存款