如果俺公司是房地产公司俺公司老板欠甲方款100万，甲方又欠乙方100万，然后经过协商，让俺公司老板用一套房子顶账给乙方，乙方到俺公司签订购房合同，但是不用交首付款，首付款俺公司垫付，然后办理按揭贷款，那么我应该怎么做分录，

你好，根据你的描述和置业判断认为，1、甲方是指你们房地产公司；2、抵账的房子所有权是房地产公司的。 
抵账的房子视同销售。 
1、签订抵账协议借：应付账款-乙方100万 贷：预收账款100万，等到房子完工时结转收入收入 
2、垫付首付款时借：其他应收款-乙方（代乙方垫付）  贷：银行存款 
收到按揭贷款时借：银行存款  贷：其他应付款-乙方 
收到按揭款应把垫付的收入款扣下借：其他应付款-乙方  贷：其他应收款-乙方 
把按揭款扣除首付款的余款转给乙方借：其他应付款  贷：银行存款 
第二部的按揭实质上是乙方的抵押贷款，由于已经抵账，贷款应该属于乙方