财务报表审计的目标是注册会计师通过执行审计工作，对财务报表的合法性和公允性发表审计意见。其中，合法性是指财务报表是否按照适用的会计准则和相关会计制度的规定编制，公允性是指在所有重大方面公允反映被审计单位的财务状况、经营成果和现金流量。