我公司将首次购买税控设备的专用发票进行了认证，是否还可以将未认证部分抵减应纳税额，关于税控设备及服务费抵减应纳税额在纳税申报表上如何填列？

您好，可以的，先把认证的转出，再全额抵扣。
《财政部、国家税务总局关于增值税税控系统专用设备和技术维护费用抵减增值税税额有关政策的通知》（财税[2012]15号）第五条规定，纳税人在填写纳税申报表时，对可在增值税应纳税额中全额抵减的增值税税控系统专用设备费用以及技术维护费，应按以下要求填报：
  增值税一般纳税人将抵减金额填入《增值税纳税申报表（适用于增值税一般纳税人）》第23栏‘应纳税额减征额’。当本期减征额小于或等于第19栏‘应纳税额’与第21栏‘简易征收办法计算的应纳税额’之和时，按本期减征额实际填写；当本期减征额大于第19栏‘应纳税额’与第21栏‘简易征收办法计算的应纳税额’之和时，按本期第19栏与第21栏之和填写，本期减征额不足抵减部分结转下期继续抵减。
  小规模纳税人将抵减金额填入《增值税纳税申报表（适用于小规模纳税人）》第11栏‘本期应纳税额减征额’。当本期减征额小于或等于第10栏‘本期应纳税额’时，按本期减征额实际填写；当本期减征额大于第10栏‘本期应纳税额’时，按本期第10栏填写，本期减征额不足抵减部分结转下期继续抵减。