公司收到加工费的增值税专用发票该怎么做会计分录

借：银行存款（或应收账款）
贷：主营业务收入（或其它业务收入）
应交税费—应交增值税（销项）[如果是小规模纳税人，则为应交税费—应交增值税]

对增值税专用发票来说，不管是销售还是加工，都是一样的。
对普通发票来说，加工，也可能有专用发票，因为现在很多地方规定各个行业使用自己的发票，在发票头上会写上“XX行业发票”的。
加工成本的摊销都是按权责发生制原则和配备原则来摊销，取得了多少的收入，就转多少的成本，在结转收入的时候同时结转相应的成本