广西壮族自治区国家税务局成立于一九九四年三月，直属国家税务总局领导，为正厅级单位。实行人员、编制、机构、经费"四垂直"管理，内设行政处室 12个、直属机构 1个、事业单位 5个、巡视办公室1个、机关党委办公室 1个、离退休干部管理办公室1个，全区国税系统在职干部总数11904 人，离退休人员5365人。广西壮族自治区国税局下辖14个市局，121个县(市、区)局，111个直属机构(其中稽查局97个，车辆购置税征收管理税务分局14个)，212个税务分局，31个税务所，168个事业单位，共有在职干部职工1.2万人。管辖纳税户558563户。

2018年6月15日，国家税务总局广西壮族自治区税务局挂牌成立，标志着原广西壮族自治区国家税务局、原广西壮族自治区地方税务局正式合并。